1999년
- 07월 매장문화재 지표조사 기관으로 지정, 문화재청
1998년
- 05월 호남지방 출토 신석기유물 특별전
제6회 호남고고학회 학술대회 - 04월 박물관 야외전시장 개관
- 03월 제8대 박물관장 박종대 교수 취임
1997년
- 11월 초청강연회 -한국 민속문화의 이해
박물관 제Ⅱ전시실 -민속실- 개관 - 08월 발굴매장문화재 위탁보관협약 체결
1996년
- 08월 박물관 제Ⅰ전시실 -역사실- 개관
- 03월 제7대 박물관장 이희환 교수 취임
1995년
- 11월 박물관 발굴유물 특별기획전
초청강연회 -신안 해저유물의 발굴성과
1994년
- 03월 제6대 박물관장 백철수 교수 취임
1992년
- 05월 민속자료 특별전시회
- 03월 제5대 박물관장 김성태 교수 취임
1991년
- 03월 종합대학교로의 개편에 따라 법정기관이 됨
1990년
- 02월 제4대 박물관장 이희환 교수 취임
